MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015942	GCC	2	6	46426	46431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198275
1002	NC_015942	CCG	2	6	46432	46437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198275
1003	NC_015942	A	6	6	46444	46449	100 %	0 %	0 %	0 %	344198275
1004	NC_015942	GCA	2	6	46501	46506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198275
1005	NC_015942	TCG	2	6	46513	46518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198275
1006	NC_015942	GCGG	2	8	46568	46575	0 %	0 %	75 %	25 %	344198275
1007	NC_015942	AGA	2	6	46667	46672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198275
1008	NC_015942	CGC	2	6	46674	46679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198275
1009	NC_015942	TGG	2	6	46756	46761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198275
1010	NC_015942	GGC	2	6	46776	46781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198275
1011	NC_015942	CGG	3	9	47008	47016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198276
1012	NC_015942	ATG	2	6	47064	47069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198276
1013	NC_015942	CCA	2	6	47095	47100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198276
1014	NC_015942	CGG	2	6	47203	47208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198276
1015	NC_015942	A	6	6	47322	47327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015942	CAGCT	2	10	47342	47351	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1017	NC_015942	TAA	2	6	47354	47359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015942	CTT	2	6	47390	47395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198277
1019	NC_015942	CGG	3	9	47413	47421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198277
1020	NC_015942	TCG	2	6	47427	47432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198277
1021	NC_015942	TGG	2	6	47454	47459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198277
1022	NC_015942	CCT	2	6	47521	47526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198277
1023	NC_015942	CGG	2	6	47533	47538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198277
1024	NC_015942	GCA	2	6	47549	47554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198277
1025	NC_015942	CGCC	2	8	47602	47609	0 %	0 %	25 %	75 %	344198277
1026	NC_015942	GCTG	2	8	47632	47639	0 %	25 %	50 %	25 %	344198277
1027	NC_015942	T	6	6	47681	47686	0 %	100 %	0 %	0 %	344198277
1028	NC_015942	CGG	2	6	47695	47700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198277
1029	NC_015942	CG	3	6	47796	47801	0 %	0 %	50 %	50 %	344198277
1030	NC_015942	GGC	2	6	47812	47817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198277
1031	NC_015942	GCT	2	6	47818	47823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198277
1032	NC_015942	GGC	2	6	47824	47829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198277
1033	NC_015942	TGTCT	2	10	47854	47863	0 %	60 %	20 %	20 %	344198277
1034	NC_015942	TCA	2	6	47886	47891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198277
1035	NC_015942	GTGCTG	2	12	47894	47905	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344198277
1036	NC_015942	CCG	2	6	47935	47940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198277
1037	NC_015942	CTG	2	6	47942	47947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198277
1038	NC_015942	AGC	2	6	47951	47956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198277
1039	NC_015942	TCA	2	6	48006	48011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198278
1040	NC_015942	CCT	3	9	48020	48028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198278
1041	NC_015942	GC	3	6	48042	48047	0 %	0 %	50 %	50 %	344198278
1042	NC_015942	TGGC	2	8	48068	48075	0 %	25 %	50 %	25 %	344198278
1043	NC_015942	ATC	2	6	48112	48117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198278
1044	NC_015942	CACC	2	8	48212	48219	25 %	0 %	0 %	75 %	344198278
1045	NC_015942	GC	3	6	48262	48267	0 %	0 %	50 %	50 %	344198278
1046	NC_015942	ACC	2	6	48292	48297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198278
1047	NC_015942	GCC	2	6	48298	48303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198278
1048	NC_015942	GGC	2	6	48312	48317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198278
1049	NC_015942	ATCC	2	8	48321	48328	25 %	25 %	0 %	50 %	344198278
1050	NC_015942	TCG	2	6	48340	48345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198278
1051	NC_015942	GCG	2	6	48346	48351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198278
1052	NC_015942	GGC	2	6	48360	48365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198278
1053	NC_015942	CTGAAG	2	12	48391	48402	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	344198278
1054	NC_015942	CAG	2	6	48420	48425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198278
1055	NC_015942	GCC	2	6	48472	48477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198278
1056	NC_015942	CCA	2	6	48596	48601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198278
1057	NC_015942	CAG	2	6	48624	48629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198278
1058	NC_015942	CCG	2	6	48635	48640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198278
1059	NC_015942	CAG	2	6	48672	48677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198278
1060	NC_015942	GAT	2	6	48689	48694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198278
1061	NC_015942	CAG	2	6	48756	48761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198278
1062	NC_015942	CGG	2	6	48782	48787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198278
1063	NC_015942	CCG	2	6	48814	48819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198278
1064	NC_015942	CAG	2	6	48828	48833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198278
1065	NC_015942	AGC	2	6	48841	48846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198278
1066	NC_015942	GGC	2	6	48854	48859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198278
1067	NC_015942	CGC	2	6	48893	48898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198278
1068	NC_015942	ATGG	2	8	48909	48916	25 %	25 %	50 %	0 %	344198278
1069	NC_015942	GCTCCG	2	12	49075	49086	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344198279
1070	NC_015942	CGC	2	6	49094	49099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198279
1071	NC_015942	CCG	2	6	49100	49105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198279
1072	NC_015942	GCT	2	6	49147	49152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198279
1073	NC_015942	CGG	2	6	49270	49275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198279
1074	NC_015942	CAG	2	6	49298	49303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198279
1075	NC_015942	CCG	3	9	49384	49392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198279
1076	NC_015942	GGGC	2	8	49423	49430	0 %	0 %	75 %	25 %	344198279
1077	NC_015942	CCG	2	6	49446	49451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198279
1078	NC_015942	CTG	2	6	49463	49468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198279
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1081	NC_015942	GCCT	2	8	49625	49632	0 %	25 %	25 %	50 %	344198279
1082	NC_015942	CAG	2	6	49676	49681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198279
1083	NC_015942	TGT	2	6	49782	49787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198279
1084	NC_015942	CAG	2	6	49792	49797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198279
1085	NC_015942	TCA	2	6	49856	49861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_015942	GAA	2	6	49916	49921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015942	ACG	2	6	49967	49972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198280
1088	NC_015942	CAT	2	6	49997	50002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198280
1089	NC_015942	AT	3	6	50043	50048	50 %	50 %	0 %	0 %	344198280
1090	NC_015942	CGCC	2	8	50086	50093	0 %	0 %	25 %	75 %	344198280
1091	NC_015942	ATC	2	6	50110	50115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198280
1092	NC_015942	TTC	2	6	50122	50127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198280
1093	NC_015942	TAG	2	6	50179	50184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198280
1094	NC_015942	GCCGG	2	10	50209	50218	0 %	0 %	60 %	40 %	344198280
1095	NC_015942	C	6	6	50332	50337	0 %	0 %	0 %	100 %	344198280
1096	NC_015942	TGG	2	6	50429	50434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198280
1097	NC_015942	ATC	2	6	50446	50451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198280
1098	NC_015942	GCGG	2	8	50497	50504	0 %	0 %	75 %	25 %	344198280
1099	NC_015942	ATA	2	6	50552	50557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198280
1100	NC_015942	TCCCA	2	10	50621	50630	20 %	20 %	0 %	60 %	344198280
1101	NC_015942	ACG	2	6	50632	50637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198280
1102	NC_015942	CCG	2	6	50659	50664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198280
1103	NC_015942	TGA	2	6	50732	50737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198280
1104	NC_015942	CAG	2	6	50780	50785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198280
1105	NC_015942	AGC	2	6	50800	50805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198280
1106	NC_015942	ACC	2	6	50950	50955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198280
1107	NC_015942	CCGT	2	8	51011	51018	0 %	25 %	25 %	50 %	344198280
1108	NC_015942	ACA	2	6	51073	51078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198280
1109	NC_015942	GC	3	6	51230	51235	0 %	0 %	50 %	50 %	344198280
1110	NC_015942	GGC	2	6	51237	51242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198280
1111	NC_015942	GGC	2	6	51252	51257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198280
1112	NC_015942	TTG	2	6	51376	51381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198280
1113	NC_015942	TAT	2	6	51479	51484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_015942	CTC	2	6	51485	51490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_015942	AAGG	2	8	51491	51498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_015942	GC	3	6	51508	51513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_015942	ATCA	2	8	51526	51533	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_015942	TAA	2	6	51555	51560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015942	TTA	2	6	51565	51570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015942	ATG	2	6	51665	51670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015942	TA	3	6	51681	51686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015942	ATT	2	6	51703	51708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_015942	ACC	2	6	51837	51842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198281
1124	NC_015942	CGA	2	6	51881	51886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198281
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1126	NC_015942	CTCG	2	8	51938	51945	0 %	25 %	25 %	50 %	344198281
1127	NC_015942	GGA	2	6	51962	51967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198281
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1146	NC_015942	TCG	2	6	53411	53416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1148	NC_015942	TGC	3	9	53534	53542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1291	NC_015942	ACCGGA	2	12	60199	60210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198290
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1344	NC_015942	GCC	2	6	62418	62423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198292
1345	NC_015942	GC	3	6	62432	62437	0 %	0 %	50 %	50 %	344198292
1346	NC_015942	GC	3	6	62468	62473	0 %	0 %	50 %	50 %	344198292
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1353	NC_015942	CTGCGC	2	12	62603	62614	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344198292
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1355	NC_015942	CG	3	6	62633	62638	0 %	0 %	50 %	50 %	344198292
1356	NC_015942	CCG	3	9	62644	62652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198292
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1362	NC_015942	GACT	2	8	62851	62858	25 %	25 %	25 %	25 %	344198292
1363	NC_015942	CCGGCA	2	12	62859	62870	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344198292
1364	NC_015942	AGT	2	6	62883	62888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198292
1365	NC_015942	CG	3	6	62920	62925	0 %	0 %	50 %	50 %	344198292
1366	NC_015942	GCC	2	6	62931	62936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198292
1367	NC_015942	GCC	2	6	62940	62945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198292
1368	NC_015942	ACC	2	6	63013	63018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198292
1369	NC_015942	GCT	2	6	63052	63057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198292
1370	NC_015942	ATGGG	2	10	63075	63084	20 %	20 %	60 %	0 %	344198292
1371	NC_015942	CGC	2	6	63146	63151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198292
1372	NC_015942	GCC	2	6	63214	63219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198292
1373	NC_015942	CTCA	2	8	63259	63266	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1374	NC_015942	GA	3	6	63306	63311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1375	NC_015942	TTG	2	6	63374	63379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1376	NC_015942	GGC	2	6	63413	63418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1377	NC_015942	GA	3	6	63455	63460	50 %	0 %	50 %	0 %	344198293
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1379	NC_015942	ATG	2	6	63513	63518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198293
1380	NC_015942	CCTGCG	2	12	63520	63531	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344198293
1381	NC_015942	TGG	2	6	63537	63542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198293
1382	NC_015942	GTTTTG	2	12	63558	63569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198293
1383	NC_015942	ACC	2	6	63620	63625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198293
1384	NC_015942	CAT	2	6	63698	63703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198293
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1386	NC_015942	TGG	2	6	63813	63818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198293
1387	NC_015942	AGC	2	6	63877	63882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198293
1388	NC_015942	GGGC	2	8	63937	63944	0 %	0 %	75 %	25 %	344198293
1389	NC_015942	TC	3	6	63953	63958	0 %	50 %	0 %	50 %	344198293
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1459	NC_015942	GCC	2	6	67241	67246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198296
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1485	NC_015942	A	6	6	68615	68620	100 %	0 %	0 %	0 %	344198299
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1487	NC_015942	GCGG	2	8	68710	68717	0 %	0 %	75 %	25 %	344198299
1488	NC_015942	T	6	6	68738	68743	0 %	100 %	0 %	0 %	344198299
1489	NC_015942	ATCT	2	8	68808	68815	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1490	NC_015942	GTA	2	6	68816	68821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1491	NC_015942	CGC	2	6	68853	68858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1492	NC_015942	TCA	2	6	68965	68970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1493	NC_015942	TGT	2	6	68980	68985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1494	NC_015942	GGC	2	6	69070	69075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1495	NC_015942	AGA	2	6	69094	69099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1496	NC_015942	AAC	2	6	69113	69118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1497	NC_015942	A	7	7	69161	69167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1498	NC_015942	CTTG	2	8	69210	69217	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1499	NC_015942	CAG	2	6	69258	69263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1500	NC_015942	GAAA	2	8	69264	69271	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

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